南京藥石藥物研發有限公司，注冊成立于2006年底，總投資565萬美元，于2008年10月在南京浦口高新技術開發區正式運行，是一家新型的高科技生物研發公司。作為一家面向全球，以市場需求為導向，以研發創新為驅動的企業，南京藥石的業務主要包括基于內部技術平臺和產品的定制合成和關鍵中間體的研發生產和技術轉讓。主要經營范圍為新穎分子砌塊的研發和銷售，關鍵中間體工藝的研發和技術轉讓，同時提供技術咨詢服務。為了適應業務擴展的需要，公司于2011年在美國舊金山灣區成立了美國藥石。 
公司專注于研發領域必需和特殊的高端試劑設計和開發，為客戶提供創新服務。公司利用自身在計算化學和合成化學方面的優勢，設計開發了一個獨特新穎的可用于創新研發的分子骨架和分子砌塊庫、包括優勢片段化合物庫和構效關系工具化合物庫，該庫共含研發急需的分子砌塊10000多種(絕大多數未商品化)，其中未見文獻報道的全新分子砌塊有3000多種。運用這一分子砌塊庫，可以迅速地發現化合物的結構與活性關系及結構與性質關系，大大提高新藥篩選和優化的效率和命中率，是創新研發的基石。基于開發這些分子砌塊過程中建立的內部獨有的化學技術平臺，公司的業務同時擴展到與內部技術和產品相關的定制合成，高難度關鍵中間體工藝的研發及產業化。公司于2011年通過了ISO9001, ISO14001 和OHSAS18001的三標體系認證  

公司現有員工151名，其中研發人員120人，博士9人（留學歸國博士6人），碩士28人，本科以上學歷員工近90%。