清華東莞創新中心（全稱：東莞深圳清華大學研究院創新中心）是根據清華大學與東莞市人民政府簽署的全面合作協議精神，由東莞市人民政府與深圳清華大學研究院于2013年5月簽訂協議共建的、以企業化方式運作的事業單位。通過自主研發、成果轉化、企業孵化、創業投資、技術和人才引進、科技與金融結合來促進東莞市高新技術產業發展。
      清華東莞創新中心恪守清華大學“自強不息，厚德載物”的校訓，以體制機制創新為核心，整合多方資源，摸索出一條官產學研資相結合促進高科技成果轉化的自主創新之路，服務于東莞市區域經濟的中長期發展戰略，推動東莞乃至珠三角地區高新技術產業的發展和自主創新能力的提升。 
      清華東莞創新中心依托深圳清華大學研究院20年來形成的創新孵化及運作經驗，構建適應東莞形勢和適合自身發展的自主創新孵化體系，促進清華大學及國內外的科研成果在東莞產業化。孵化體系各功能板塊之間相互支撐、相互融通，覆蓋了項目從研發投入到成果產出的全過程。2015年1月，清華東莞創新中心作為深圳清華大學研究院創新孵化體系的組成部分，獲得了廣東省科學技術獎勵最高獎-特等獎。
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