南京生物醫藥谷地處南京市西北部，長江北岸，南京高新技術產業開發區內（以下簡稱“南京高新區”），是南京市委、市政府在產業布局上明確重點規劃建設的南京生物醫藥產業基地。
    南京高新區由江蘇省、南京市政府共同創建于1988年4月，1991年3月經國務院批準為全國首批、江蘇省首家國家高新技術產業開發區。先后被國家科技部、商務部等部委授予國家高新技術產品出口基地、國家火炬計劃軟件產業基地、國家火炬計劃軟件產業基地、中國服務外包基地城市示范區等國家產業基地，形成了軟件及信息服務、生物醫藥、新材料新能源等三大主導產業集群。區域規劃面積160平方公里，已開發建成面積20多平方公里。
    生物醫藥產業是南京高新區自建區以來始終堅持發展的重點產業，經過20多年的發展，歷經江蘇省“三藥”科技產業示范基地、“江蘇省新藥創業服務中心”、“江蘇省生物醫藥產業集聚區”等發展階段。
    2010年，南京市委、市政府決定在南京高新區高標準規劃建設南京生物醫藥谷，將生物醫藥產業作為南京市重點發展的戰略性新興產業，通過市級的產業規劃、土地供應、環保審批、產業政策等行政手段，整合南京市生物醫藥產業資源，優化產業布局，引導生物醫藥產業逐步向南京生物醫藥谷集中發展。為此，2011年初南京市政府派出機構南京高新區管委會專門成立了管理運營機構——南京生物醫藥谷發展中心/南京生物醫藥谷建設發展有限公司，并為南京生物醫藥谷規劃了全新的區域發展空間，占地10平方公里，其中研發區3平方公里，產業區7平方公里，位于南京高新區龍王山麓，南京大學浦口校區西側。
    經過2年的發展，南京生物醫藥谷產業發展已初具規模。2012年底，南京生物醫藥谷已集聚生物醫藥企業156家，當年實現產業總收入42億元，較上年同期增長達40%，當年新引進生物醫藥企業27家。南京生物醫藥谷入住生物醫藥企業中，70%以上是研發創新型科技企業，擁有自主知識產權，市場競爭力強，其中年收入過億元企業9家，1000萬元以上企業20多家。
    南京生物醫藥谷生物醫藥產業類別也漸趨完善，企業從事的產業領域涵蓋生物制藥、化學制藥、醫療器械、研發外包、中醫藥等多個門類，其中包括：
    化學制藥：代表企業有南京瑞爾醫藥有限公司、南京南大藥業有限責任公司等；
    生物制藥：代表企業有南京綠葉思科藥業有限公司、南京健友生物化學制劑有限公司等；
    醫療器械（含診斷試劑）：代表企業有南京微創醫學科技有限公司、南京雙威生物醫學科技有限公司、南京諾爾曼生物技術有限公司等；
    CRO（生物醫藥研發外包）：代表企業有金斯康科技（南京）有限公司、南京藥石藥物研發有限公司、南京邁達醫藥科技有限公司等；
    中醫藥（含生物保健制品）：代表企業有南京海昌中藥飲片有限公司、南京圣諾生物科技實業有限公司、南京老山營養保健品有限公司等。
    在產業基礎設施方面，南京生物醫藥谷已建成生物醫藥科技孵化器2個，分別是南京留學人員創業園、鼎業百泰生物科學園，建成孵化面積12萬平米。目前，南京生物醫藥谷正在加速推進產業基礎設施開發建設。在3平方公里的研發區，主干道路已基本建成，孵化器、加速器、中試基地、科技商務服務中心等科技載體已全面開工建設，建筑面積20多萬平米，預計2014年底將全部建成。在7平方公里的產業區，道路基礎設施建設正全面展開。
在產業發展方面，南京生物醫藥谷尤其注重培育新興的生物醫藥研發創新產業鏈，在大力引進生物醫藥科技企業的同時，重點建設生物醫藥研發公共技術服務平臺，以滿足處于創業發展階段的中小型生物醫藥科技企業對技術條件及產業鏈上下游服務的專業化需要。尤其是在創新藥物研發及外包方面，目前南京生物醫藥谷已入住的生物醫藥科研機構及企業所從事的業務領域覆蓋小分子藥物篩選、藥效學研究、藥理毒理學研究、動物疾病模型、臨床數據服務等，形成了較為完整的新藥研發產業鏈。其中國家科研機構有南京大學醫藥生物技術國家重點實驗室、長效緩控釋和靶向制劑及技術國家重點實驗室、南京大學模式動物研究所/模式動物與疾病研究教育部重點實驗室等5個。
隨著南京生物醫藥谷產業基礎設施及配套環境的日趨完善，必將吸引生物醫藥科技企業加速集聚。
    當前，南京生物醫藥谷正按照南京市委、市政府的文件精神和要求，以建設“全國領先、世界一流”的生物醫藥科技園區為目標，高起點規劃，高標準建設，在風景秀麗的龍王山麓精心打造專業化高標準的生物醫藥科技園區。