南京長澳醫藥科技有限公司是長澳藥業的下屬子公司。 
公司成立于1999年8月，以創新藥研發服務為首任，是一個專業從事新藥研制開發、技術咨詢、市場調研以及合同臨床服務、產品注冊服務的新型科技主導型研究及服務機構。同時，向國內外制藥公司提供全方位、高品質的實驗室研發、注冊臨床等高性價比的外包服務及新藥技術轉讓和技術服務，幫助他們縮短新藥開發周期、降低新藥開發成本、獲得新產品。 
公司自成立以來，發展迅速，2006年收購上海陽帆醫藥科技有限公司，2008年與美國XenBiotic（美新諾醫藥科技公司）成立合作性策略聯盟，為國內外新藥研發機構提供整體性服務，公司近年來承擔國家及省市級科技計劃29項，其中科技計劃7項，包括國家科技型中小企業技術創新基金項目2項，國家863計劃重大科技專項1項，國家十一五科技重大專項重大新藥創制4項。目前已擁有62項國內專利，6項國際申請，4項國外申請，共15項授權專利。擁有16個省市級的高新技術產品并建立了實驗動物中心。公司為高新技術企業，擁有科技人員百余人，管理團隊由一批具有豐富醫藥研發經驗和管理經驗的專業人士組成。實驗室位于經濟技術開發區南京新港和上海張江藥谷的兩處場所，面積超過30,000m2，為國內大型醫藥研發機構。