山東省蔬菜工程技術研究中心于2000年經山東省科技廳批準掛牌成立。2011年底，正式變更依托單位為山東省壽光蔬菜產業集團有限公司。2015年，經山東省科技廳批準升級為省級示范工程中心，更名為“山東省設施蔬菜工程技術研究中心”。中心作為集團的育種研發機構，致力于培育自主知識產權的蔬菜品種，振興民族種業。
集團先后對中心投入5億元，創建一流育種機構。其中，投資2億多元建立了中國（壽光）蔬菜種業科技創新孵化器；投資1.8億元建立了占地1600畝的蔬菜種業創新創業基地；投資5000萬元建設了分子育種實驗室，配備國際先進的儀器設備119臺、套，開展了分子與細胞工程育種與單倍體組織培養等實驗室工作，建設了種子資源庫以保存國內外收集的優良種子資源；配套建設了占地500多畝的育種基地。
公司積極開展合作育種，與中國農科院、國家蔬菜工程技術研究中心、中國農業大學、西北農林科技大學、華中農業大學、山東省農科院、山東農業大學、青島農業大學及荷蘭綠港國際、瓦赫寧根大學、AXIA種子公司等多家國內外科研機構、大型種業集團建立廣泛的合作研究，形成產學研、育繁推創新格局。
公司致力于商業化育種，加強與科研單位合作育種，推動育繁推一體化，努力打造國家蔬菜“種子硅谷”。